More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6047 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  100 
 
 		 353 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  56.29 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  55.86 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  51.88 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  51.72 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  32.67 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  31.34 
 
 		 543 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  33.24 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  30.14 
 
 		 529 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  32.27 
 
 		 367 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  30.65 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  29.72 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  31.16 
 
 		 523 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  30.55 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  27.89 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  29.71 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  27.27 
 
 		 537 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  29.41 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  29.7 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  28.77 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  30.88 
 
 		 521 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  28.14 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  28.14 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  26.67 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  27.42 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  27.47 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  27.78 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  25.95 
 
 		 423 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  29.72 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  27.36 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26.62 
 
 		 484 aa  85.9  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  27.95 
 
 		 463 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  25.9 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  30.2 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  24.83 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  26.32 
 
 		 449 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.39 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  47.62 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  25.54 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  25.1 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.74 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  41.18 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  28.19 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  27.87 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  27.38 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.36 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  23.97 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  24.9 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  24.46 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  42.45 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  24.14 
 
 		 469 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.66 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.61 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  28 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  28 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  25.19 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  27.57 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  27.57 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  25.31 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.19 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  36.17 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.6 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  22.2 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.17 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  26.39 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  23.41 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  36.9 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  36.9 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  43.24 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  37.93 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  34.26 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  46.25 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.78 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  25.12 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.41 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  41.25 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  26.78 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  30.77 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  34.52 
 
 		 492 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  39.78 
 
 		 478 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  25 
 
 		 494 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  42.53 
 
 		 452 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  34.57 
 
 		 503 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 516 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  33.04 
 
 		 531 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  36.62 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  37.36 
 
 		 478 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  37.63 
 
 		 478 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25.55 
 
 		 482 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  37.63 
 
 		 478 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25.55 
 
 		 482 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.55 
 
 		 487 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  26.14 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.7 
 
 		 487 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  32.94 
 
 		 500 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>