77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1957 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  100 
 
 		 423 aa  880    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  40.68 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  33.74 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  31.95 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  33.65 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  31.59 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  31.59 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  31.84 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  31.43 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  33.65 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  30.92 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  30.79 
 
 		 382 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  30.22 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  31.59 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  29.89 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  28.54 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  29.81 
 
 		 523 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  30.9 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  29.36 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  28.92 
 
 		 543 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  27.86 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  28.81 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  27.6 
 
 		 521 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  24.82 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  25.95 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  27.95 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  25.87 
 
 		 365 aa  97.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  26.82 
 
 		 352 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  24.25 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  22.32 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.95 
 
 		 532 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  21.76 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  29.27 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  22.17 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  31.58 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  23.83 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  27.4 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.06 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  22.22 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  20.97 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  29.38 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  22.75 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  21.85 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  23.06 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.59 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  27.95 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  27.95 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  27.55 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  27.95 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  28.14 
 
 		 578 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  22.22 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  27.4 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  22.63 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  23.03 
 
 		 498 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  28.08 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  27.14 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  25.29 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  27.33 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  24.66 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  25 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  27.23 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  25.28 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26.73 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  22.06 
 
 		 625 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.34 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  21.09 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  28.29 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.41 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  28.29 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  28.22 
 
 		 494 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  22.7 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.18 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  48.84 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.13 
 
 		 619 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  53.66 
 
 		 589 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  22.58 
 
 		 565 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>