173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4367 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  78.34 
 
 		 493 aa  789    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  71.17 
 
 		 490 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  78.38 
 
 		 532 aa  804    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  99.39 
 
 		 578 aa  995    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  99.39 
 
 		 494 aa  993    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  100 
 
 		 494 aa  998    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  61.63 
 
 		 498 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  62.97 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  60.62 
 
 		 492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  63.49 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  63.49 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  57.36 
 
 		 494 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  58.47 
 
 		 498 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  58.47 
 
 		 498 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  38.66 
 
 		 465 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  37.64 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  37.28 
 
 		 459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  36.86 
 
 		 499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  37.25 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  37.25 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  37.03 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  36.18 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  36.8 
 
 		 492 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  34.21 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  36.63 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  35.45 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  32.15 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  33.77 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  36.36 
 
 		 463 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  33.93 
 
 		 458 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  33.26 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  36.1 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  34.51 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  31.21 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  31 
 
 		 459 aa  183  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  34.64 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  34.06 
 
 		 463 aa  170  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  29.19 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  29.1 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  30.56 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  30.82 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  30.5 
 
 		 445 aa  143  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  32.06 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  32.53 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 492 aa  116  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25.11 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  28.45 
 
 		 480 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  27.05 
 
 		 625 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.17 
 
 		 592 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  23.83 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  29.18 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  28.98 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.73 
 
 		 619 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  25.62 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.52 
 
 		 616 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.31 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  27.21 
 
 		 624 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.46 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  27.93 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.46 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  25.32 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.93 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  28.2 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25.56 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  25.84 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  24.57 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  25.09 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  31.73 
 
 		 543 aa  66.6  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  23.18 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  28.99 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  27.47 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  30.17 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  25.29 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.22 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  20.14 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  28.51 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  26.8 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  22.22 
 
 		 365 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  39.13 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  28.57 
 
 		 523 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  24.84 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  27.29 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  55.56 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  30.12 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  21.36 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  44.58 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  20.4 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  20.18 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  27.73 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.19 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  27.2 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  23.2 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  27.14 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  27.73 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  27.23 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  23.76 
 
 		 527 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  34.69 
 
 		 396 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  34.23 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>