More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1580 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  99.09 
 
 
439 aa  870    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  73.42 
 
 
447 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  100 
 
 
450 aa  897    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  100 
 
 
450 aa  897    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  72.52 
 
 
446 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  66.07 
 
 
454 aa  547  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  44.89 
 
 
459 aa  355  6.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  41.74 
 
 
465 aa  322  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  40.48 
 
 
499 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  39.2 
 
 
449 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  39.47 
 
 
492 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  39 
 
 
452 aa  276  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  39.14 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  38.29 
 
 
492 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  39.05 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  36.47 
 
 
459 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  38.91 
 
 
493 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  38.91 
 
 
493 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  35.59 
 
 
498 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  35.59 
 
 
498 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  37.22 
 
 
484 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
494 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  37.47 
 
 
578 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  37.25 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  35.51 
 
 
494 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  36.73 
 
 
532 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  36.16 
 
 
456 aa  239  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  35.94 
 
 
457 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  35.76 
 
 
493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  34.97 
 
 
456 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  36.06 
 
 
490 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  35.6 
 
 
498 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  36.06 
 
 
463 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  35.92 
 
 
445 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  30.04 
 
 
464 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  33.63 
 
 
463 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  34.32 
 
 
462 aa  202  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  33.79 
 
 
458 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  31.28 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  34.5 
 
 
444 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  31.2 
 
 
487 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 
492 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  30.24 
 
 
510 aa  166  9e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  32.17 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.54 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  32.38 
 
 
438 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.21 
 
 
479 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.77 
 
 
459 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  26.86 
 
 
435 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.95 
 
 
496 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.95 
 
 
496 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  26.05 
 
 
592 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  22.37 
 
 
436 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  30.65 
 
 
352 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.74 
 
 
495 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  27.56 
 
 
565 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  27.27 
 
 
619 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  27.27 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.89 
 
 
625 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  30.6 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  31.4 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  27.19 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  26.21 
 
 
616 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  25.22 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  26.23 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.37 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
510 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  26.93 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.08 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  21.91 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.02 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  24.4 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  30.26 
 
 
435 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  21.94 
 
 
478 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25.34 
 
 
480 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.2 
 
 
485 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  31.05 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  21.31 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.46 
 
 
482 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.46 
 
 
482 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.53 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.46 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.17 
 
 
490 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  31.6 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.46 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  21.77 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.96 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  21.43 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  21.38 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  21.38 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  21.52 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.2 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  20.94 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.17 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  24.8 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  21.1 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>