240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0946 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
495 aa  1003    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  55.89 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  30.11 
 
 
492 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  27.2 
 
 
491 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.45 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.45 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.74 
 
 
482 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.69 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  25.69 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.27 
 
 
478 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.69 
 
 
478 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.48 
 
 
478 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.48 
 
 
478 aa  123  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  26.14 
 
 
490 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 
469 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.23 
 
 
456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.02 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.02 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.02 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.23 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.69 
 
 
478 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  26.21 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  26.02 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.02 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.87 
 
 
487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.82 
 
 
490 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.03 
 
 
478 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  27.62 
 
 
457 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
492 aa  99.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  24.18 
 
 
573 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  25.74 
 
 
459 aa  91.3  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.61 
 
 
459 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.49 
 
 
487 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  25.79 
 
 
503 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.85 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  25.16 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  23.88 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  24.52 
 
 
457 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.11 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  26.48 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.12 
 
 
592 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  25.11 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  26.03 
 
 
530 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  24.84 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  23.54 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.68 
 
 
496 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  23.38 
 
 
527 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.25 
 
 
625 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.47 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  23.74 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  24.78 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.72 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  25.22 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  25.22 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.46 
 
 
624 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  25.05 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  23.31 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  24.07 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.84 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  23.4 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  22.49 
 
 
533 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  22.06 
 
 
535 aa  70.1  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.32 
 
 
619 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  21.92 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.53 
 
 
616 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  22.3 
 
 
537 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.45 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.12 
 
 
619 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  21.37 
 
 
531 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  23.03 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  23.35 
 
 
458 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  24.6 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  22.49 
 
 
557 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  21.93 
 
 
516 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  23.41 
 
 
463 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  28.38 
 
 
507 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  23.87 
 
 
439 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  24.14 
 
 
444 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  26.1 
 
 
418 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  24.91 
 
 
624 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  23.67 
 
 
537 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.3 
 
 
492 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  21.76 
 
 
525 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.24 
 
 
528 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  23.17 
 
 
353 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  22.63 
 
 
564 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  59.26 
 
 
532 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  23.34 
 
 
438 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  22.53 
 
 
510 aa  60.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  20.5 
 
 
464 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  24.45 
 
 
446 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  25.85 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  23.62 
 
 
427 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  22.42 
 
 
533 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  24.02 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  24.2 
 
 
454 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  24.95 
 
 
536 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  39.42 
 
 
541 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  26.43 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>