212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0682 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  70.58 
 
 		 510 aa  687    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  100 
 
 		 512 aa  1032    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  57.91 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  55.35 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  56.73 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  34.57 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  34.08 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  31.7 
 
 		 484 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  32.73 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  33.07 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  31.59 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.86 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  33 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  33.88 
 
 		 454 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  28.17 
 
 		 492 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  29.94 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  29.94 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  29.9 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  32.41 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  30.77 
 
 		 456 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  30.65 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  30.35 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  32.2 
 
 		 493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  30.93 
 
 		 498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  32.2 
 
 		 493 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  32.2 
 
 		 493 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 494 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  32.06 
 
 		 578 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  30.77 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  32.06 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  32.17 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  32.17 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.49 
 
 		 469 aa  144  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  28.72 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  28.8 
 
 		 494 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  29.41 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  28.82 
 
 		 487 aa  134  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  31.69 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  30.79 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  25.34 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.4 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  25.1 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  22.84 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  24.21 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  27.99 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  23.69 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  27.18 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  28.96 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  26.28 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  25.44 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  28.5 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  22.03 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.68 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  28.72 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  42.5 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  24.89 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  27.31 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  25.12 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1039  electron transfer flavoprotein-ubiquinone dehydrogenase  48.21 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.86 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  35.56 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  28.51 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23.14 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  27.88 
 
 		 368 aa  56.6  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  28.01 
 
 		 382 aa  56.6  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  28.38 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  22.29 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  23.67 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  41.67 
 
 		 378 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.4 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  25.71 
 
 		 427 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  33.13 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  31.48 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  29.95 
 
 		 387 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  29.95 
 
 		 387 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  23.77 
 
 		 528 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0942  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.67 
 
 		 554 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  53.33 
 
 		 351 aa  53.9  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.71 
 
 		 496 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  34.65 
 
 		 523 aa  53.5  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1777  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor  46.67 
 
 		 551 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.964971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1392  electrotransfer ubiquinone oxidoreductase  46.67 
 
 		 553 aa  53.5  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  22.61 
 
 		 510 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0424  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.67 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  26.45 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25.34 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2473  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.67 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0484  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.33 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  51.92 
 
 		 545 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  36.9 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0425  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.33 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  22.81 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  33.68 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  24.71 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3745  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50 
 
 		 549 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6299  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.33 
 
 		 549 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.78 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  35 
 
 		 378 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1221  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  41.67 
 
 		 541 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.022805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>