115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0981 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  100 
 
 		 368 aa  759    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  48.62 
 
 		 365 aa  358  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  40.11 
 
 		 378 aa  265  7e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  38.27 
 
 		 381 aa  255  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  39.5 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  41.62 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  40.27 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  38.32 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  39.66 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  38.84 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  38.84 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  42.22 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  41.67 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  36.04 
 
 		 371 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  35.97 
 
 		 378 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  31.43 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  35.28 
 
 		 529 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  35.38 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  34.44 
 
 		 543 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  33.7 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  33.89 
 
 		 547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  36.83 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  32.69 
 
 		 537 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  33.24 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  31.42 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  28.38 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  31.63 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  30.91 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  32.08 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  32.41 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  32.68 
 
 		 458 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  29.2 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  28.57 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  29.15 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  31.12 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  30.4 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  30.45 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  33.68 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  29.45 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  40.19 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  28.86 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  29.67 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  28.21 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  31.2 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  26.77 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  26.77 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  29.71 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  28.25 
 
 		 459 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  29.46 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.06 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  27.38 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  30.24 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.68 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  33.52 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  33.52 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  29.26 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.38 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.89 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  27.38 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  27.38 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  25.58 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  26.49 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.78 
 
 		 445 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  27.35 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.94 
 
 		 492 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 		 492 aa  52.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 494 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  26.59 
 
 		 494 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  26.34 
 
 		 510 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  26.22 
 
 		 578 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  30.92 
 
 		 510 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  29.29 
 
 		 498 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  29.29 
 
 		 498 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.05 
 
 		 487 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  36.59 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  38.46 
 
 		 516 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  31.58 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1837  hypothetical protein  31.58 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  50 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  31.58 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  43.48 
 
 		 1274 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  53.85 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  38.33 
 
 		 657 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  45.65 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  43.9 
 
 		 418 aa  46.2  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  47.62 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  46.67 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.44 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  39.58 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  40.82 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  38.81 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.61 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.61 
 
 		 495 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  46.67 
 
 		 495 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.67 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.44 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  40 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>