166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3390 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  100 
 
 		 448 aa  879    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  48.87 
 
 		 423 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  44.65 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  43.96 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  40.66 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  40.27 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  37.44 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.83 
 
 		 426 aa  192  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  30.48 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  37.5 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  31.43 
 
 		 438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  32.71 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  38.8 
 
 		 414 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  36.78 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  34.44 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.11 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  33.41 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  37.81 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  32.45 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  37.22 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  31.05 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  32.97 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  33.11 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  31.17 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  32.76 
 
 		 431 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  31.55 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  31.7 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  31.58 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  35.57 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  29.35 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  27.66 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.14 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  50.68 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.48 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  36.07 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  28.62 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  36.59 
 
 		 487 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  30.36 
 
 		 413 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  41.89 
 
 		 359 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  52.46 
 
 		 367 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  51.61 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  51.61 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  41.58 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  32 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  46.75 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  43.88 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  44.44 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  36.36 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  32.67 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.88 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  37.18 
 
 		 490 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  35.37 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  35.37 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  35.37 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  35.37 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  35.37 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  35.37 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.35 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  43.04 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  37.18 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  35.37 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  27.06 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  43.64 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  41.25 
 
 		 444 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  27.33 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  35.88 
 
 		 313 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  41.82 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  52.63 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  43.64 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  27.65 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  28.03 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  40.85 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  50.98 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  33.96 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  26.04 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  49.02 
 
 		 657 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  33.55 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  56.82 
 
 		 543 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  40.74 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  49.02 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  30.82 
 
 		 509 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  61.9 
 
 		 427 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  36.17 
 
 		 949 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  50 
 
 		 439 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  44.62 
 
 		 342 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  44.62 
 
 		 342 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.78 
 
 		 647 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 		 346 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  23.16 
 
 		 417 aa  46.6  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  27.12 
 
 		 423 aa  46.6  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  44 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  33.77 
 
 		 599 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  38.24 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  36.23 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  32.18 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>