277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5169 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  100 
 
 		 433 aa  852    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  51.34 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  42.07 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  40.64 
 
 		 394 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  33.94 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  42.12 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  37.06 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  41.86 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  38.6 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  38.85 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  34.89 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  32.29 
 
 		 470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  42.93 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  36.52 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  35.9 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  35.12 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.44 
 
 		 410 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  33.65 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  37.14 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  35.7 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  36.28 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  33.09 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  32.62 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  32.4 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  34.76 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  33.33 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  31.78 
 
 		 437 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  31.76 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  36.68 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.42 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.59 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  28.89 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  27.33 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  47.06 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  25.11 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.99 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.42 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  47.06 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  28.57 
 
 		 645 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  53.06 
 
 		 508 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  25.72 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  37.25 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  45.61 
 
 		 507 aa  53.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  41.46 
 
 		 344 aa  53.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  46.43 
 
 		 571 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  45.45 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  30 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 338 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  45.45 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  40 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  53.06 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  36.67 
 
 		 657 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  38.54 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  38.36 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  43.64 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 570 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  38.36 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  46.3 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  31.36 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  44.62 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  47.06 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  50 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  46.15 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  42.11 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  46.15 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  53.06 
 
 		 507 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  35.87 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  46.15 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  44.9 
 
 		 537 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  41.82 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  47.06 
 
 		 493 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  27.06 
 
 		 570 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  60 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  27.32 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 580 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  41.82 
 
 		 501 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  41.18 
 
 		 509 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  43.14 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  47.46 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  39.08 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  50.88 
 
 		 503 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  45.1 
 
 		 515 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  42.03 
 
 		 448 aa  50.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  45.28 
 
 		 546 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  42.11 
 
 		 511 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  28.11 
 
 		 460 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  36.05 
 
 		 548 aa  49.7  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  44.62 
 
 		 506 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  48.98 
 
 		 552 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  51.02 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  41.86 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  45.28 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  42.11 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  43.1 
 
 		 504 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  46.55 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  45.28 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  53.49 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>