More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1312 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  100 
 
 		 446 aa  884    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  61.02 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  52.9 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  55.92 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  54.85 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  43.68 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  40.27 
 
 		 428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  39.95 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  41.91 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  38.39 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  34.13 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  32.89 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  39.19 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  35.28 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.08 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  34.52 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  35.31 
 
 		 423 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  34.18 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  34.16 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  34.62 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  33.1 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  35.2 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  30.8 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  30.98 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  29.51 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  31.44 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  29.87 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  29.95 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  26.5 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  26.23 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.26 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.4 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.26 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.26 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  32.54 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  22.97 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.59 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  30.17 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.5 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.89 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.15 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.08 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  30.72 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.08 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  23 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  26.27 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  25.19 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  29.77 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  30.64 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  24.13 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  26.85 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  24.95 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  31.82 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  27.67 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  24.74 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  23.05 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  21.49 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  29.87 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  23.47 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  31.21 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  25.31 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  38.96 
 
 		 599 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  23.22 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24 
 
 		 508 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  23.71 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  25.92 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25.31 
 
 		 478 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.9 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  22.59 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  37.1 
 
 		 645 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.16 
 
 		 437 aa  53.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  46.27 
 
 		 496 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  22.13 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.78 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  24.14 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  30.17 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  30.17 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  29.51 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.42 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  22.5 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  23.53 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  23.53 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.12 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  23.53 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  49.09 
 
 		 542 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  23.79 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.07 
 
 		 660 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 531 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  21.9 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  41.94 
 
 		 647 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  52.73 
 
 		 503 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  39.44 
 
 		 537 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  41.94 
 
 		 647 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.07 
 
 		 660 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 510 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  36.99 
 
 		 465 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.57 
 
 		 652 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.574765 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  41.18 
 
 		 502 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>