More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1454 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  100 
 
 
456 aa  870    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3831  amine oxidase  48.37 
 
 
438 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  27.87 
 
 
495 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  26.69 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  21.3 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  28.02 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.04 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  28.96 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  28.96 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  28.96 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  28.96 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  28.96 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  31.52 
 
 
465 aa  63.9  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  53.33 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  29.45 
 
 
463 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  27.22 
 
 
503 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  50.68 
 
 
448 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  26.95 
 
 
474 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0283  putative oxidoreductase  28.96 
 
 
1309 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  32.71 
 
 
420 aa  60.1  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  27.14 
 
 
492 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  31.38 
 
 
488 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  30.37 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  49.23 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.59 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  33.73 
 
 
499 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.53 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  52.63 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  38.58 
 
 
414 aa  56.6  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  23.37 
 
 
436 aa  56.6  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  41.01 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  29.56 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  27.54 
 
 
487 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  25.39 
 
 
454 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  26.2 
 
 
488 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  27.58 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  32.93 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  32.78 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  27.98 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 
450 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  28.05 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  50.85 
 
 
463 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  45.33 
 
 
500 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  28.05 
 
 
459 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  44 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  44 
 
 
500 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  33.04 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  27.53 
 
 
427 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  26.95 
 
 
490 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.79 
 
 
485 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  47.37 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.34 
 
 
439 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  23.85 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  33.04 
 
 
427 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  33.54 
 
 
436 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  29.09 
 
 
462 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  30.03 
 
 
445 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  31.69 
 
 
410 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  40.26 
 
 
482 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 
487 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 
482 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  22.89 
 
 
491 aa  53.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  33.08 
 
 
436 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  40.79 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  40.24 
 
 
570 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  29.35 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  54 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  28.46 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.63 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  30.49 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  33.08 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  31.1 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  29.1 
 
 
470 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  43.59 
 
 
437 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  42.67 
 
 
500 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  29.91 
 
 
473 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  43.84 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  33.08 
 
 
436 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  46.67 
 
 
459 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  31.94 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  40.79 
 
 
487 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  31.08 
 
 
450 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
446 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  31.08 
 
 
450 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
446 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  32.62 
 
 
394 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  28.77 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  29.49 
 
 
505 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  22.51 
 
 
479 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.5 
 
 
502 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  49.18 
 
 
465 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  65.79 
 
 
512 aa  50.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
510 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  22.48 
 
 
466 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>