186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3418 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  100 
 
 		 413 aa  794    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  88.38 
 
 		 413 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  50.37 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  47.49 
 
 		 414 aa  275  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  46.38 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  37.74 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  42.12 
 
 		 433 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  36.43 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  35.7 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  46.21 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  37.56 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  40.24 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  38.31 
 
 		 451 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  40.24 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  37.18 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  40.14 
 
 		 415 aa  193  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  36.47 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  34.59 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  35.06 
 
 		 410 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  37.44 
 
 		 436 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  37.42 
 
 		 448 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  34.23 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  33.49 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  32.94 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  32.77 
 
 		 427 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  33.04 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  32.61 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  32.06 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  35.22 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.36 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.67 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  34.92 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  30.79 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.82 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  45.26 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  24.17 
 
 		 467 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  27.91 
 
 		 476 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  38.18 
 
 		 506 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  50 
 
 		 949 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  29.95 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  28.51 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  56.82 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  47.54 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  31.3 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  29.15 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.48 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  30.91 
 
 		 645 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  41.1 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  29.35 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  31.02 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  29.35 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  45.21 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  49.02 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  56 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  47.06 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  31.25 
 
 		 452 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  31.25 
 
 		 452 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  39.73 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  31.25 
 
 		 452 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  47.06 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  50 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  51.11 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  40.26 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  28.16 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.85 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  34.76 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  45.76 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  33.73 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  33.51 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  32.32 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  32.41 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  33.1 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  43.28 
 
 		 599 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  27.72 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  27.07 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  31.15 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  27.5 
 
 		 542 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  23.81 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  48.28 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  27.22 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  51.79 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  46.43 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  38.78 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.48 
 
 		 640 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  38.78 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  41.79 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  41.18 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  30.43 
 
 		 619 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 642 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 642 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  58.54 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  34.15 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  45.1 
 
 		 543 aa  47  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  50 
 
 		 698 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  44.44 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  50 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  32.41 
 
 		 484 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  30.43 
 
 		 619 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  47.27 
 
 		 479 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>