More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2442 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  100 
 
 
427 aa  855    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  56.13 
 
 
425 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  56.37 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  48.69 
 
 
410 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  43.09 
 
 
420 aa  292  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  40.47 
 
 
455 aa  276  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  42.13 
 
 
418 aa  263  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  41.34 
 
 
437 aa  262  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  39.29 
 
 
446 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  40 
 
 
431 aa  258  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.96 
 
 
468 aa  248  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  37.24 
 
 
438 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  40.09 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  33.41 
 
 
470 aa  213  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  37 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  35.55 
 
 
426 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  33.33 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  33.97 
 
 
418 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  35.21 
 
 
394 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  33.26 
 
 
448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  32.44 
 
 
413 aa  143  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  32.45 
 
 
413 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  34.17 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  33.33 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  31.98 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  30.39 
 
 
433 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  33.12 
 
 
418 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  32 
 
 
415 aa  117  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  26.96 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  29.73 
 
 
413 aa  77  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.95 
 
 
589 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  27.43 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  27.43 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  27.43 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  26.69 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  22.44 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  22.28 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  28.46 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 
467 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  26.76 
 
 
490 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  21.68 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  24.09 
 
 
455 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  22.5 
 
 
599 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  28.35 
 
 
438 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  26.2 
 
 
488 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  21.17 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.73 
 
 
642 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  26.32 
 
 
639 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  47.54 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  28 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  23.64 
 
 
471 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  24.2 
 
 
477 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.17 
 
 
552 aa  60.1  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  28.28 
 
 
419 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  31.15 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  38.67 
 
 
624 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  28.3 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  40 
 
 
548 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  26.5 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  28.73 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  22.05 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  21.86 
 
 
453 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  32.61 
 
 
359 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  25.32 
 
 
471 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  22.44 
 
 
453 aa  57  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  52.63 
 
 
358 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.17 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  32.29 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.17 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  26.38 
 
 
492 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.17 
 
 
487 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  22.54 
 
 
483 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  23.64 
 
 
425 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  48 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  34.26 
 
 
487 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  26.28 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.93 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  27.12 
 
 
470 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.62 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  41.94 
 
 
647 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.81 
 
 
492 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  25.89 
 
 
503 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.86 
 
 
485 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  33.33 
 
 
482 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  25.76 
 
 
415 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.68 
 
 
472 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  45.9 
 
 
435 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  22.27 
 
 
647 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  30.61 
 
 
474 aa  53.5  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  22.27 
 
 
647 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  21.75 
 
 
453 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  43.14 
 
 
488 aa  53.9  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.52 
 
 
451 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  31.25 
 
 
466 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  33.33 
 
 
490 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  31.25 
 
 
466 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>