More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0036 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  64.81 
 
 		 647 aa  902    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 647 aa  1347    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  64.97 
 
 		 647 aa  902    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  65 
 
 		 645 aa  905    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  67.03 
 
 		 648 aa  914    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.94 
 
 		 642 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.28 
 
 		 643 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.42 
 
 		 640 aa  340  5e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.31 
 
 		 639 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 		 644 aa  320  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  32.66 
 
 		 639 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  34.72 
 
 		 811 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  32.41 
 
 		 482 aa  127  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  28.06 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  33.63 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  31.62 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  32.74 
 
 		 508 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  33.8 
 
 		 551 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  30.7 
 
 		 506 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  30.7 
 
 		 506 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  30.7 
 
 		 506 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  27.81 
 
 		 523 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  29.52 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  29.19 
 
 		 519 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  30.18 
 
 		 546 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  28.89 
 
 		 552 aa  84.3  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.1 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  26.72 
 
 		 453 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  25.49 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  25.36 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  25.82 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.07 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  23.6 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  25.41 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.59 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  26.59 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  26.52 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.99 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  25.41 
 
 		 624 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  26.17 
 
 		 506 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  24.09 
 
 		 599 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  24.18 
 
 		 453 aa  72  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  27.78 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.72 
 
 		 459 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  26.22 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  26.79 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  28.73 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  27.76 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  28.02 
 
 		 475 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  25.64 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  26.36 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.24 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  25.48 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  44.87 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  27.6 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  25.64 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  27.2 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  27.2 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.55 
 
 		 207 aa  67  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.39 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  25.38 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  26.4 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.28 
 
 		 138 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.91 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  28.48 
 
 		 479 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  26.74 
 
 		 589 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  27 
 
 		 478 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  61.9 
 
 		 141 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  24.15 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  40.7 
 
 		 146 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  24.82 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  23.98 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  22 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.03 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.9 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  45.9 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  45.76 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.9 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.85 
 
 		 130 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.25 
 
 		 167 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  57.45 
 
 		 131 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.88 
 
 		 179 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.95 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  47.37 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52 
 
 		 130 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  47.17 
 
 		 136 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.57 
 
 		 139 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  25.19 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.48 
 
 		 155 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  24.15 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  38.46 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  54.17 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>