188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0204 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  100 
 
 		 435 aa  872    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  37.35 
 
 		 447 aa  299  6e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  38.39 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  38.5 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  36.77 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  36.89 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  37.61 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  38.55 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  30.49 
 
 		 1293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  25.74 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 460 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  28.57 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  28.1 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  28.67 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.88 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 		 532 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  28.89 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  25.68 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  28.51 
 
 		 421 aa  146  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  25.16 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.42 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  25.94 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  27.71 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  26.77 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  27.91 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  22.56 
 
 		 472 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  24.94 
 
 		 480 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  25.58 
 
 		 511 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  27.54 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  27.06 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  28.51 
 
 		 516 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.94 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  24.5 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  25.86 
 
 		 507 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  26.21 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  24.25 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.84 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  25.48 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  26.44 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.05 
 
 		 722 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  25.11 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  24.62 
 
 		 520 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25.11 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25.11 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  24.31 
 
 		 537 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  23.91 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  22.2 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  26.13 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  20.52 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  21.9 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  20.3 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.91 
 
 		 1033 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.62 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  22.87 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  26.84 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  25.86 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  26.43 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  23.14 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  25.09 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  26.35 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  23.33 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  24 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  26.34 
 
 		 396 aa  53.5  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  25.29 
 
 		 370 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  40.68 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  42.37 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.23 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  41.79 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.67 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  36.84 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  33.63 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  36.84 
 
 		 468 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  25.09 
 
 		 509 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  25.44 
 
 		 372 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  26.67 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  25.75 
 
 		 527 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  37.29 
 
 		 501 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  25.71 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  32.43 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  34.58 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  40.68 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  48.08 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  35.53 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  40.68 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  38.33 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  38.98 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  50 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  38.33 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  32.38 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  27.84 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  38.03 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  23.3 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  46.3 
 
 		 537 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  40.35 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  39.39 
 
 		 647 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>