81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0064 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1138    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  76.13 
 
 		 1033 aa  845    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  58.82 
 
 		 519 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  56.03 
 
 		 538 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  46.79 
 
 		 537 aa  494  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  47.64 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  39.81 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  39.3 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  39.62 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  40.76 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  40.44 
 
 		 512 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  40.34 
 
 		 511 aa  379  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  38.22 
 
 		 524 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  40.49 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  39.67 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  37.71 
 
 		 500 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  38.55 
 
 		 520 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  37.52 
 
 		 511 aa  360  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  37.21 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  37.82 
 
 		 498 aa  356  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  38.59 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  30.51 
 
 		 465 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  32.08 
 
 		 463 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  32.08 
 
 		 463 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 450 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  32.08 
 
 		 463 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  28.97 
 
 		 436 aa  207  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.22 
 
 		 465 aa  125  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.05 
 
 		 722 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  22.49 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.29 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  24.37 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  24.17 
 
 		 452 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.85 
 
 		 538 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  23.19 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.94 
 
 		 449 aa  97.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25.25 
 
 		 447 aa  97.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  23.36 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 489 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  22.34 
 
 		 1293 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  22.35 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  22.11 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  21.95 
 
 		 446 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.22 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  21.59 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  22.2 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  19.51 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  20.29 
 
 		 532 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  24.83 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  20.23 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  20.96 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  29.17 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  20.94 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  21.06 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  27.55 
 
 		 373 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  22.42 
 
 		 428 aa  54.3  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.37 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  24.87 
 
 		 394 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  36.62 
 
 		 814 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  23.47 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  20.98 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  24.75 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  30.66 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  36.36 
 
 		 524 aa  47  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  36.36 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  23.44 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.79 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.71 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4287  putative monooxygenase  41.79 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  20.47 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  24.29 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  25.12 
 
 		 366 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2059  putative monooxygenase  38.71 
 
 		 506 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  22.82 
 
 		 369 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 		 529 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  35.82 
 
 		 525 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  31.03 
 
 		 493 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  22.07 
 
 		 419 aa  43.9  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  20.57 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  23.88 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  44.44 
 
 		 436 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>