64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4750 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  885    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  67.66 
 
 
465 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  64.37 
 
 
463 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  64.37 
 
 
463 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  64.14 
 
 
463 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  36.63 
 
 
516 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  37.45 
 
 
512 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  35.28 
 
 
496 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  36.42 
 
 
500 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  35.14 
 
 
494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  36.24 
 
 
524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  36.89 
 
 
507 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  34.49 
 
 
498 aa  264  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  34.68 
 
 
520 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  36.15 
 
 
511 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  35.98 
 
 
500 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  36.59 
 
 
500 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  34.76 
 
 
480 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  34.81 
 
 
511 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  30.34 
 
 
472 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  30.38 
 
 
519 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  28.97 
 
 
549 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
539 aa  187  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.23 
 
 
1033 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  26.21 
 
 
538 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  28.15 
 
 
537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
450 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  25.76 
 
 
446 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  24.64 
 
 
436 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  22.07 
 
 
454 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  23.34 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  25.93 
 
 
437 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 
489 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  23.13 
 
 
447 aa  90.1  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  21.43 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  23.6 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.08 
 
 
449 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  25.43 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  24.12 
 
 
538 aa  73.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  26.13 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  27.87 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  21.71 
 
 
459 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  23.53 
 
 
452 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  20.99 
 
 
431 aa  64.7  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  22.94 
 
 
460 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  21.48 
 
 
459 aa  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  25.22 
 
 
1293 aa  63.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  22.57 
 
 
449 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.45 
 
 
491 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  22.63 
 
 
421 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  24.04 
 
 
450 aa  60.5  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  20.7 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
532 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  18.37 
 
 
429 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  19.6 
 
 
722 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  19.67 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  19.2 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  25.87 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  23.38 
 
 
469 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  28.45 
 
 
393 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  29.41 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  22.61 
 
 
435 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  21.62 
 
 
443 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>