63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0216 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  73.48 
 
 		 460 aa  692    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 452 aa  941    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  74.39 
 
 		 449 aa  709    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  51.69 
 
 		 454 aa  471  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  50.11 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  41.04 
 
 		 532 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  39.75 
 
 		 538 aa  333  3e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  30.09 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  29.48 
 
 		 1293 aa  190  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  27.95 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  26.92 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  28.67 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  25.79 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.61 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  30.85 
 
 		 450 aa  143  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  25.3 
 
 		 446 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  27.34 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  23.16 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.72 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  24.36 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  25.79 
 
 		 507 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  21.93 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.95 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  24.28 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  26.89 
 
 		 511 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  26.08 
 
 		 520 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  24.39 
 
 		 500 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  27.19 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  25 
 
 		 524 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  22.94 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  22.36 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  24.48 
 
 		 511 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  24.08 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  24.93 
 
 		 516 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  21.13 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 		 722 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.81 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  21.59 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  21.07 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  22.08 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  20.74 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  23.32 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  24.06 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  20.95 
 
 		 1033 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  23.53 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  25 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.12 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.11 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.11 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  21.97 
 
 		 539 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  24.26 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  22.25 
 
 		 537 aa  50.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  22 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  19.65 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  22.17 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  43.1 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  43.1 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  51.28 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1290  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>