177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3088 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 367 aa  770    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  66.76 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  63.46 
 
 		 381 aa  494  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  63.19 
 
 		 381 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  61.2 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  62.84 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  61.2 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  60.93 
 
 		 383 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  60.82 
 
 		 383 aa  484  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  60 
 
 		 381 aa  481  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  60.16 
 
 		 391 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  46.72 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  45.65 
 
 		 395 aa  334  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  44.99 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  45.41 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  45.11 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  44.44 
 
 		 409 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  45.23 
 
 		 395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  44.05 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  43.13 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  45.92 
 
 		 372 aa  315  7e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  45.28 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  42.53 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  45.38 
 
 		 395 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  44.35 
 
 		 413 aa  309  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  42.51 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  43.35 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  43.28 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  43.28 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  43.28 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  42.97 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  41.91 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  43.82 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  45.03 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  44.35 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  42.63 
 
 		 392 aa  298  9e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  44.11 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 		 366 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  41.87 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 		 367 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  40.92 
 
 		 413 aa  290  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  42.47 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  42.58 
 
 		 365 aa  285  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 368 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  42.19 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  42.13 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  42.15 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  44.44 
 
 		 371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  42.97 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  41.03 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  41.21 
 
 		 783 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  41.31 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  41.32 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  41.05 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.02 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  40.98 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  40.54 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  36.59 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 		 370 aa  253  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.45 
 
 		 383 aa  252  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  39.01 
 
 		 814 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  38.32 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  39.51 
 
 		 783 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  37 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  34.9 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  34.86 
 
 		 391 aa  228  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.31 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.6 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  36.93 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  37.06 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  37.14 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  36.2 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  33.51 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.53 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  24.5 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  23.02 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  27.98 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  27.98 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  29.17 
 
 		 511 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  39.76 
 
 		 490 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  38.55 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  38.55 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  38.55 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  39.76 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  38.55 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  38.55 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  38.55 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  38.55 
 
 		 490 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  37.35 
 
 		 490 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  24.69 
 
 		 465 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  24.33 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  28.82 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  22.86 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  28.57 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  34.69 
 
 		 478 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>