89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1171 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
395 aa  812    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  78.88 
 
 
395 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  76.08 
 
 
395 aa  621  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  76.14 
 
 
389 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  74.3 
 
 
395 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  72.26 
 
 
395 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  72.01 
 
 
409 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  74.35 
 
 
386 aa  598  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  73.46 
 
 
381 aa  581  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  71.2 
 
 
395 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  70.23 
 
 
415 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  69.59 
 
 
394 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  68.62 
 
 
395 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  68.64 
 
 
413 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  67.87 
 
 
398 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  67.77 
 
 
425 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  67.77 
 
 
399 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  67.77 
 
 
399 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  67.95 
 
 
428 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  67.18 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  65.9 
 
 
402 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  65.73 
 
 
399 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  65.6 
 
 
383 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  61.2 
 
 
392 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  59.45 
 
 
413 aa  486  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  46.32 
 
 
372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  44.89 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  45.74 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  45.09 
 
 
367 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 
383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  43.95 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  43.54 
 
 
380 aa  326  5e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  44.56 
 
 
372 aa  325  6e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  45.84 
 
 
383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  44.29 
 
 
370 aa  319  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  42.9 
 
 
381 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  44.92 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  42.51 
 
 
381 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  44.41 
 
 
381 aa  312  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  41.49 
 
 
365 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  42.53 
 
 
367 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 
367 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  42.97 
 
 
368 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  43.32 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  42.06 
 
 
383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 
383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 
383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  41.58 
 
 
396 aa  295  9e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  42.52 
 
 
371 aa  293  5e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  40.75 
 
 
814 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  40.96 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 
393 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 
379 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 
393 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  43.35 
 
 
376 aa  279  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  40.69 
 
 
377 aa  278  9e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  43.35 
 
 
376 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 
373 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 
372 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 
390 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  40.74 
 
 
399 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.57 
 
 
383 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  41.02 
 
 
363 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 
783 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  36.97 
 
 
364 aa  262  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 
783 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  40.25 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  35.4 
 
 
391 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 
369 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  35.45 
 
 
373 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  36.13 
 
 
386 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  34.03 
 
 
382 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.54 
 
 
391 aa  239  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  36 
 
 
370 aa  236  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  34.9 
 
 
375 aa  232  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.13 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  33.59 
 
 
400 aa  206  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  35.13 
 
 
369 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.48 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  20.78 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  20.54 
 
 
465 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.13 
 
 
447 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  29.61 
 
 
245 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  23.68 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  24.59 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.73 
 
 
496 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.59 
 
 
459 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  51.11 
 
 
757 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  27.52 
 
 
484 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>