85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2694 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  94.68 
 
 
409 aa  783    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  76.96 
 
 
395 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
395 aa  818    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  72.26 
 
 
395 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  73.67 
 
 
395 aa  607  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  69.62 
 
 
395 aa  594  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  72.22 
 
 
386 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  69.37 
 
 
389 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  68.7 
 
 
395 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  65.73 
 
 
395 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  66.24 
 
 
394 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  64.81 
 
 
415 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  66.49 
 
 
381 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  65.81 
 
 
402 aa  537  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  65.46 
 
 
413 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  65.46 
 
 
399 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  65.46 
 
 
428 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  65.46 
 
 
399 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  64.95 
 
 
425 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  64.54 
 
 
398 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  64.07 
 
 
399 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  65.26 
 
 
392 aa  519  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  59.65 
 
 
413 aa  502  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  60.15 
 
 
399 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  58.4 
 
 
383 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  47.23 
 
 
366 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  46.17 
 
 
372 aa  344  2e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  45.65 
 
 
383 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  45.97 
 
 
384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  46.56 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  45.23 
 
 
381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  45.21 
 
 
370 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  44.62 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  44.99 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  43.72 
 
 
370 aa  323  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  44.67 
 
 
383 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  43.72 
 
 
368 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  44.56 
 
 
372 aa  322  6e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  43.87 
 
 
381 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  43.24 
 
 
365 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 
367 aa  319  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  43.39 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  42.48 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  42.63 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  43.04 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 
383 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  42.55 
 
 
371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  42.3 
 
 
391 aa  301  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  43.31 
 
 
376 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  40.74 
 
 
814 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  41.24 
 
 
379 aa  279  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  41.99 
 
 
376 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  39.28 
 
 
396 aa  277  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  41.22 
 
 
377 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  41.22 
 
 
398 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  38.81 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 
372 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.36 
 
 
383 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 
363 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  38.27 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  36.15 
 
 
364 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 
373 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  38.27 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 
399 aa  259  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  38.99 
 
 
460 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  35.66 
 
 
391 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  40.72 
 
 
369 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  38.42 
 
 
783 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.32 
 
 
391 aa  247  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.87 
 
 
370 aa  247  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  35.36 
 
 
373 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  35.06 
 
 
382 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  38.83 
 
 
783 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.97 
 
 
386 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  33.86 
 
 
375 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 
400 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  32.91 
 
 
404 aa  196  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  33.87 
 
 
369 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.84 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  21.38 
 
 
394 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.11 
 
 
459 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.29 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  38.46 
 
 
511 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  34.25 
 
 
492 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>