106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1076 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 370 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  71.2 
 
 		 368 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  70.05 
 
 		 367 aa  547  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  63.81 
 
 		 366 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  60.49 
 
 		 370 aa  494  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  60.66 
 
 		 367 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  60.76 
 
 		 372 aa  481  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  60.88 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  58.76 
 
 		 372 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  58.24 
 
 		 365 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  57.61 
 
 		 380 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  56.99 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  55.23 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  45.69 
 
 		 409 aa  332  8e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  45.21 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  45.58 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  45.7 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  44.71 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  44 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  43.83 
 
 		 386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  44.29 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.58 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  44.89 
 
 		 413 aa  316  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  44.18 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  43.75 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  44.62 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  42.13 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  42.13 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  41.55 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  41.28 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  41.24 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  39.62 
 
 		 383 aa  292  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  43.44 
 
 		 383 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  42.94 
 
 		 379 aa  285  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  42.97 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  42.43 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.21 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  41.9 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  42.12 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.19 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  39.21 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  40.66 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  40.71 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  39.25 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  39.25 
 
 		 376 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  39.12 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  39.51 
 
 		 814 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 		 383 aa  256  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  38.36 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  40.55 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 		 783 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  40.34 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  37.93 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  36.65 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  38.36 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  38.06 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.7 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  38.25 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  34.29 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  37.03 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  37.13 
 
 		 783 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.15 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  36.36 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.46 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  32.81 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  21.79 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  23.81 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  27.88 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  30.63 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  36.47 
 
 		 484 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  30.95 
 
 		 476 aa  46.2  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  21.63 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  27.93 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  27.93 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  32.53 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.02 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  27.93 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  27.93 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  27.93 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  27.93 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  27.93 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.73 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  40 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  39.34 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  34.48 
 
 		 469 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  32.95 
 
 		 511 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>