97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14770 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 370 aa  768    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  72.95 
 
 		 371 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  63.11 
 
 		 367 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  61.75 
 
 		 368 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  60.49 
 
 		 370 aa  494  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  63.22 
 
 		 372 aa  482  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  59.34 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  59.44 
 
 		 366 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  60.38 
 
 		 372 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  57.3 
 
 		 367 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  54.84 
 
 		 380 aa  435  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  54.26 
 
 		 391 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  53.19 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  47.53 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  43.72 
 
 		 395 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  47.73 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  45.79 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  46.01 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 409 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  44.8 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  43.83 
 
 		 386 aa  315  9e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  44.92 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  45.14 
 
 		 402 aa  312  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  45.28 
 
 		 415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  44.59 
 
 		 394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  45.68 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  42.63 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  44.83 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  45.07 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  44.83 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  44.83 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  45.21 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  44.9 
 
 		 398 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  45.03 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  43.5 
 
 		 399 aa  299  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  44 
 
 		 395 aa  298  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  42.67 
 
 		 381 aa  298  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  43.41 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  43.44 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  41.58 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  41.37 
 
 		 383 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  41.62 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  41.6 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  41.32 
 
 		 383 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 413 aa  291  9e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  42.59 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  41.92 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.94 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  41.4 
 
 		 376 aa  279  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  41.1 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  38.9 
 
 		 814 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 		 399 aa  271  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.34 
 
 		 383 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  40.72 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  39.61 
 
 		 391 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  40.5 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  39.67 
 
 		 783 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  40.8 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  38.29 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  39.45 
 
 		 783 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  40.74 
 
 		 369 aa  248  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  38.25 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  34.82 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  38.27 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  39.8 
 
 		 460 aa  239  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 364 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  38.44 
 
 		 375 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.86 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  37.37 
 
 		 391 aa  224  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  32.98 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.53 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.16 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  24.43 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  20.14 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  21.6 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.29 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.65 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  23.9 
 
 		 511 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  22.73 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  41.94 
 
 		 529 aa  46.6  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  24.14 
 
 		 500 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  25.58 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  37.93 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  24.07 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  26.51 
 
 		 512 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  23.96 
 
 		 496 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  34.43 
 
 		 476 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>