88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3214 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
386 aa  791    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  62.76 
 
 
382 aa  520  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  58.95 
 
 
375 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  55.94 
 
 
373 aa  441  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  53.42 
 
 
391 aa  441  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  50.78 
 
 
814 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  50.4 
 
 
399 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  51.19 
 
 
373 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  49.74 
 
 
400 aa  386  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  51.05 
 
 
383 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  49.36 
 
 
404 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  50 
 
 
377 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  49.74 
 
 
372 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  47.89 
 
 
390 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  48.29 
 
 
379 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  46.46 
 
 
398 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  45.05 
 
 
369 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  47.76 
 
 
364 aa  352  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  46.97 
 
 
363 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  43.83 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  44.09 
 
 
393 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  44.74 
 
 
783 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  44.01 
 
 
783 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  45.5 
 
 
369 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  44.19 
 
 
376 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  43.41 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  43.83 
 
 
370 aa  299  5e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  38.27 
 
 
415 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  39.74 
 
 
367 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  39.53 
 
 
380 aa  258  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  39.53 
 
 
372 aa  256  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  38.63 
 
 
460 aa  256  6e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 
367 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  37.24 
 
 
394 aa  252  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  37.89 
 
 
396 aa  251  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  37.28 
 
 
391 aa  250  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  38.17 
 
 
395 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  36.86 
 
 
389 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  37.96 
 
 
365 aa  249  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  38.68 
 
 
391 aa  247  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  36.57 
 
 
395 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  36.46 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  35.53 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  39.8 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  37.93 
 
 
370 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  38.28 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  35.26 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  37.66 
 
 
366 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  36.13 
 
 
395 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  36.02 
 
 
399 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  35 
 
 
383 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  35.77 
 
 
413 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  37.6 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  34.76 
 
 
386 aa  239  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  35.35 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  35.01 
 
 
399 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  35.01 
 
 
399 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  35.01 
 
 
428 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  35.93 
 
 
398 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  35.79 
 
 
425 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  36.22 
 
 
409 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  36.24 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  35.86 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  35.4 
 
 
381 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  35.97 
 
 
395 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  34.67 
 
 
392 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  35.92 
 
 
395 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  35.64 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  35.01 
 
 
402 aa  232  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  35.64 
 
 
371 aa  228  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  35.31 
 
 
367 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  34.47 
 
 
413 aa  227  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  35.01 
 
 
383 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  33.5 
 
 
383 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  36.6 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  33.84 
 
 
399 aa  219  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  34.21 
 
 
381 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  26.75 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  26.6 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  20.84 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.56 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  35.71 
 
 
492 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  52.38 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  35.94 
 
 
454 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  30 
 
 
484 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  33.78 
 
 
461 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  48.84 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>