92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08330 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 371 aa  774    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  72.95 
 
 		 370 aa  577  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  61.2 
 
 		 367 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  61.67 
 
 		 368 aa  478  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  60.88 
 
 		 370 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  58.7 
 
 		 372 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  58.54 
 
 		 372 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  57.3 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  58.22 
 
 		 367 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  56.23 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  55.05 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  54.84 
 
 		 380 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  54.93 
 
 		 391 aa  425  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  45.7 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  42.55 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  43.93 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  43.24 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  43.13 
 
 		 392 aa  298  8e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  41.76 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  42.52 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  42.18 
 
 		 394 aa  292  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  43.01 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  45.33 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  42.55 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  42.29 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  43.08 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  44.12 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  39.7 
 
 		 413 aa  286  4e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 		 395 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  42.34 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  42.34 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  43.01 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  42.12 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  41.01 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  41.32 
 
 		 383 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  41.05 
 
 		 383 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  41.05 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  43.14 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  42.3 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  41.95 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  41.18 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  41.76 
 
 		 393 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  40.82 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  42.7 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  44.44 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  42.55 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.71 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  40.69 
 
 		 395 aa  272  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  40.21 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  41.37 
 
 		 783 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  40.22 
 
 		 814 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  42.5 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 373 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  39.4 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  38.44 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  40.9 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 363 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.23 
 
 		 383 aa  248  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  38.33 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  39.26 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  38.12 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  39.34 
 
 		 783 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  39.14 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  38.32 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.64 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  37.74 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  35.85 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  32.55 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  33.42 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  35.91 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  37.69 
 
 		 460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  34.44 
 
 		 391 aa  199  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  33.08 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  35.68 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  22.01 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  25.77 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.6 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  28.31 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  25.42 
 
 		 520 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  23.98 
 
 		 511 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  22.42 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  33.33 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  24.24 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  24.85 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  27.06 
 
 		 484 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.15 
 
 		 500 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>