176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0851 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
363 aa  755    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  64.27 
 
 
399 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  61.16 
 
 
379 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  62.5 
 
 
390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  62.15 
 
 
383 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  62.26 
 
 
372 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  60.61 
 
 
814 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  64.64 
 
 
369 aa  461  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  61.54 
 
 
398 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  61.11 
 
 
377 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  58.68 
 
 
373 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  60 
 
 
393 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  59.12 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  57.65 
 
 
783 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  57.85 
 
 
783 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  48.08 
 
 
364 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  46.97 
 
 
386 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  48.79 
 
 
373 aa  345  8.999999999999999e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  48.53 
 
 
375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  47.14 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  47.67 
 
 
376 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 
382 aa  325  5e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  43.29 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  45.78 
 
 
369 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  42.22 
 
 
391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 
367 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  41.13 
 
 
404 aa  293  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  41.1 
 
 
400 aa  288  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  41.89 
 
 
366 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  42.7 
 
 
381 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 
415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 
370 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  40.88 
 
 
368 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 
395 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  39.95 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  40.36 
 
 
460 aa  269  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 
384 aa  269  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 
389 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 
365 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  40.77 
 
 
383 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 
395 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  41.16 
 
 
381 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 
372 aa  265  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  40.61 
 
 
367 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  41.02 
 
 
395 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  40.5 
 
 
370 aa  263  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  39.29 
 
 
381 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  39.02 
 
 
391 aa  260  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 
395 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  41.24 
 
 
409 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  41.58 
 
 
372 aa  259  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  40.96 
 
 
381 aa  259  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  41.27 
 
 
383 aa  259  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  40.98 
 
 
367 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  38.42 
 
 
380 aa  255  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  39.1 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  39.79 
 
 
392 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  37.27 
 
 
396 aa  250  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  37.85 
 
 
383 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  39.3 
 
 
386 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  38.73 
 
 
413 aa  250  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  38.29 
 
 
391 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  39.1 
 
 
395 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  37.57 
 
 
383 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 
371 aa  249  7e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  37.57 
 
 
383 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  39.57 
 
 
402 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  37.89 
 
 
383 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  40.43 
 
 
398 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  38.73 
 
 
395 aa  245  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  41.22 
 
 
399 aa  245  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  39.47 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  38.77 
 
 
413 aa  235  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  37.96 
 
 
425 aa  235  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  36.9 
 
 
428 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  36.9 
 
 
399 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  36.9 
 
 
399 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  26.88 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.33 
 
 
369 aa  92.8  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  26.63 
 
 
465 aa  60.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  29.31 
 
 
500 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  28.74 
 
 
500 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  32.69 
 
 
484 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  52.5 
 
 
245 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  35.9 
 
 
476 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  53.85 
 
 
470 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  24.86 
 
 
511 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.1 
 
 
571 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.91 
 
 
527 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  20.45 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  43.9 
 
 
447 aa  47.4  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  24.71 
 
 
500 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 
554 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  52.38 
 
 
505 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  50 
 
 
359 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
537 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  35.44 
 
 
483 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  26.32 
 
 
524 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>