89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13843 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  80.81 
 
 		 398 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  86.26 
 
 		 399 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  86.26 
 
 		 399 aa  715    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  100 
 
 		 399 aa  826    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  87.63 
 
 		 425 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  86.29 
 
 		 428 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  77.81 
 
 		 402 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  88.3 
 
 		 413 aa  725    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  77.3 
 
 		 415 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  76.35 
 
 		 394 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  71.76 
 
 		 395 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  73.15 
 
 		 389 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  66.75 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  68.26 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  66.67 
 
 		 395 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  67.18 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  64.39 
 
 		 395 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  64.63 
 
 		 409 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  64.07 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  64.45 
 
 		 386 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  62.53 
 
 		 381 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  59.6 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  59.37 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  56.22 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  54.7 
 
 		 413 aa  438  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  45.36 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  45.72 
 
 		 372 aa  325  7e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  44.74 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  43.54 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  43.78 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  44.74 
 
 		 372 aa  312  7.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  44.62 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  42.86 
 
 		 365 aa  308  8e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  44.62 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  43.65 
 
 		 380 aa  306  6e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  43.35 
 
 		 367 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  42.4 
 
 		 391 aa  301  9e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  44.09 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 370 aa  299  7e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  42.04 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  40.96 
 
 		 381 aa  292  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  42.59 
 
 		 381 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  41.07 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  40.63 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  40.63 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  42.08 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  41.95 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 379 aa  272  9e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  38.62 
 
 		 814 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  37.8 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  38.72 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  39.63 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  41.39 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  40.87 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  37.23 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  40.58 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  38.83 
 
 		 377 aa  259  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.58 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  35.79 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  38.21 
 
 		 783 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  36.02 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  34.67 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.47 
 
 		 363 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  36.98 
 
 		 783 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  34.95 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  39.14 
 
 		 460 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.77 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  32.9 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.93 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  36.29 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  36.12 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  32.56 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  33.69 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.99 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.73 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.23 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.73 
 
 		 459 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  23.53 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  24.62 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  38.37 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  24.58 
 
 		 494 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  35.29 
 
 		 484 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>