94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0161 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  77.81 
 
 		 399 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 402 aa  834    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  81.28 
 
 		 425 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  83.08 
 
 		 399 aa  688    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  81.11 
 
 		 413 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  83.08 
 
 		 399 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  83.67 
 
 		 398 aa  703    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  83.08 
 
 		 428 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  74.74 
 
 		 415 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  74.48 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  69.72 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  72.68 
 
 		 389 aa  581  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  67.95 
 
 		 395 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  67.1 
 
 		 395 aa  541  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  65.3 
 
 		 409 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  65.81 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  66.15 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  67.94 
 
 		 395 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  65.9 
 
 		 395 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  67.28 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  61.64 
 
 		 381 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  61.44 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  58.78 
 
 		 383 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  52.91 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  54.41 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  45.33 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  47.06 
 
 		 372 aa  330  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  45.57 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  45.5 
 
 		 367 aa  325  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  46.11 
 
 		 372 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  43.47 
 
 		 391 aa  318  9e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  44.85 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  45.14 
 
 		 370 aa  312  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  43.75 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  44.92 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  42.26 
 
 		 384 aa  308  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  42.51 
 
 		 367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  43.52 
 
 		 383 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  42.42 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  42.55 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  43.63 
 
 		 381 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  41.42 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 381 aa  289  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  40.96 
 
 		 814 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  39.15 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  39.15 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  41.53 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  42.22 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  42.22 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 		 383 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.04 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  38.1 
 
 		 379 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  37.53 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  36.97 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  37.97 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  39.63 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.1 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.52 
 
 		 399 aa  259  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  39.42 
 
 		 460 aa  253  6e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  38.1 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.57 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.33 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  36.84 
 
 		 783 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  37.25 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  38.95 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  34.77 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  37.04 
 
 		 783 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.01 
 
 		 386 aa  232  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  33.59 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  35.98 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  34.18 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 		 375 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  33.91 
 
 		 404 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  33.77 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.39 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  25.44 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 		 459 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 511 aa  46.6  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  27.32 
 
 		 437 aa  46.6  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  27.07 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  52.38 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  25.86 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  26.55 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.64 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.43 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  47.73 
 
 		 245 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  43.1 
 
 		 544 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 554 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  32.47 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 		 483 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>