127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0876 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  99.74 
 
 
383 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  99.22 
 
 
383 aa  804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
383 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  73.63 
 
 
384 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  60.58 
 
 
383 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  58.84 
 
 
381 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  59.15 
 
 
381 aa  491  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  60.93 
 
 
367 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  56.23 
 
 
381 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  57.49 
 
 
391 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  55.82 
 
 
383 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  43.82 
 
 
381 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  43.85 
 
 
395 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  42.23 
 
 
415 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  42.3 
 
 
395 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  43.67 
 
 
392 aa  312  5.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 
395 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 
409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  41.94 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  42.19 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  42.23 
 
 
395 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  42.7 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  41.42 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  41.39 
 
 
399 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  41.35 
 
 
394 aa  295  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  40.78 
 
 
395 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  40.25 
 
 
413 aa  293  4e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  41.32 
 
 
370 aa  292  7e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 
372 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  41.02 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  40.37 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  40.85 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.61 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  38.61 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  39.5 
 
 
366 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  40.96 
 
 
425 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 
383 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  41 
 
 
372 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 
428 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 
399 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  41.05 
 
 
371 aa  280  2e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 
399 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  40.21 
 
 
370 aa  279  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  41.06 
 
 
399 aa  278  8e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  38.02 
 
 
380 aa  279  8e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 
398 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 
402 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 
396 aa  275  8e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  40.83 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 
398 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  39.56 
 
 
391 aa  272  6e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  39.55 
 
 
367 aa  272  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  41.55 
 
 
373 aa  272  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 
379 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  40.06 
 
 
393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  40.22 
 
 
783 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  39.22 
 
 
393 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 
370 aa  259  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  38.66 
 
 
814 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.23 
 
 
383 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  37.63 
 
 
376 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  39.46 
 
 
783 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  37.57 
 
 
363 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  36.83 
 
 
376 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  36.64 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35 
 
 
386 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  36.53 
 
 
382 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  35.71 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  37.79 
 
 
391 aa  229  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  37.09 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  33.68 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.31 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  34.88 
 
 
460 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 
400 aa  206  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  32.21 
 
 
404 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  22.86 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.15 
 
 
500 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  25.86 
 
 
498 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  29.59 
 
 
511 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  21.68 
 
 
394 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  26.59 
 
 
500 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  22.82 
 
 
421 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  24.14 
 
 
494 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  24.86 
 
 
500 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.79 
 
 
424 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.98 
 
 
459 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  32.95 
 
 
482 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  32.95 
 
 
478 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  32.95 
 
 
478 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  33.67 
 
 
487 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  28.66 
 
 
480 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  27.34 
 
 
478 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  27.34 
 
 
478 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  32.65 
 
 
487 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  27.34 
 
 
478 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  32.65 
 
 
482 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  32.65 
 
 
482 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>