212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1072 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  879    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  45.61 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.42 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  28.6 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  27.39 
 
 		 447 aa  149  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  28.51 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  26.19 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  24.88 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  25.71 
 
 		 450 aa  116  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  25.81 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  21.99 
 
 		 431 aa  94  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.94 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  26.18 
 
 		 500 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.54 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  23.03 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.4 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  23.45 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  29.13 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  25.81 
 
 		 538 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  27.68 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  21.24 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  22.08 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  29.26 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  23.21 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  30.22 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  24.01 
 
 		 1293 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  24.04 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  24.83 
 
 		 549 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  27.75 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  23.82 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  29.03 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  25.63 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 539 aa  67.4  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  24.5 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  27.37 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.09 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  22.15 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  26.48 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  22.64 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  22.17 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  26.09 
 
 		 538 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.31 
 
 		 1033 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  22.63 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  21.75 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  20.14 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  24.05 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  22.54 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  23.29 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  21.75 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  21.79 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  23.27 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  23.27 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  21.14 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  19.91 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  20.19 
 
 		 372 aa  57  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  24.48 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  27.88 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  23.29 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  22.86 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  23.35 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  28.74 
 
 		 383 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  65.79 
 
 		 488 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  23.06 
 
 		 383 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  29.34 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  26.82 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  26.95 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  22.35 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  18.41 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  22.82 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  26.72 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  28.88 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  45.1 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  21.44 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  26.67 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  56.41 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  22.59 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.36 
 
 		 431 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  25.15 
 
 		 814 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 450 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  21.45 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  18.99 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  63.89 
 
 		 2126 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  26.9 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  25.73 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  53.85 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.85 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  27.32 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  51.28 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.53 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  26.32 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  28.66 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  26.32 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  35.44 
 
 		 491 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  51.28 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  26.27 
 
 		 467 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.85 
 
 		 502 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  26.54 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>