45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4100 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  100 
 
 		 467 aa  955    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  28.96 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  25.37 
 
 		 1293 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.42 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  24.93 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  26.65 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.47 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  25 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  23.77 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.38 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.86 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.68 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  24.69 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  27.51 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  21.57 
 
 		 532 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  24.95 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  24.23 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  23.42 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.4 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.36 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  20.58 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  22.24 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  24.02 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  20.63 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  21.88 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  21.68 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  18.61 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  23.08 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  24.54 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  19.12 
 
 		 722 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  19.94 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  19.68 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  38.03 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  24.89 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  31.68 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  20.42 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  31.68 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  31.68 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  30.86 
 
 		 537 aa  43.5  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 539 aa  43.5  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>