64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1512 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  100 
 
 
454 aa  938    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  68.46 
 
 
452 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  53.72 
 
 
449 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  51.69 
 
 
452 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  51.86 
 
 
460 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  41.39 
 
 
532 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  40.5 
 
 
538 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  31.19 
 
 
1293 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  30.89 
 
 
431 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  29.37 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  30.53 
 
 
450 aa  161  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  28.57 
 
 
435 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  27.89 
 
 
428 aa  152  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  28.47 
 
 
437 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  27.87 
 
 
447 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  27.55 
 
 
436 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  28.06 
 
 
449 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  27.6 
 
 
446 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  27.12 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  26.89 
 
 
427 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  25.74 
 
 
507 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  23.63 
 
 
472 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  23.62 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.47 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  25.37 
 
 
500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  22.98 
 
 
520 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  22.74 
 
 
496 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  24.37 
 
 
549 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  23.72 
 
 
511 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  23.4 
 
 
500 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  24.24 
 
 
516 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  23.96 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  24.08 
 
 
524 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  23.16 
 
 
512 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  24.1 
 
 
465 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.6 
 
 
431 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  22.07 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  23.13 
 
 
511 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.47 
 
 
424 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  20.58 
 
 
498 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.26 
 
 
1033 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  21.95 
 
 
494 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  23.33 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  23.33 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  23.33 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  22.77 
 
 
519 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  23.58 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.45 
 
 
459 aa  73.6  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  22.62 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.24 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  22.94 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  20.97 
 
 
722 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  21.84 
 
 
539 aa  66.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 
489 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  22.15 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  20.91 
 
 
465 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.54 
 
 
491 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  21.13 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  23.55 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  32.03 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  23 
 
 
416 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  31.82 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  24.6 
 
 
372 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.77 
 
 
447 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>