75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2685 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  75.22 
 
 		 460 aa  731    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  74.39 
 
 		 452 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  100 
 
 		 449 aa  930    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  53.72 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  52.14 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  41.04 
 
 		 532 aa  359  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  40.16 
 
 		 538 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  30.88 
 
 		 431 aa  208  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  29.69 
 
 		 1293 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  29.6 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  32.31 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  28.64 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.7 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  28.89 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  25.72 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.65 
 
 		 428 aa  128  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  26.39 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  25.06 
 
 		 428 aa  123  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  25.75 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  22.86 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.65 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  25.16 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  23.84 
 
 		 500 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.84 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  23.57 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  23.43 
 
 		 480 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  23.99 
 
 		 511 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  25.05 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  22.98 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.25 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.81 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  23.18 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  21.48 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.03 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  22.65 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 		 722 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  24.72 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  21.47 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  21.12 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.45 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  28.42 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  20.23 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  20.9 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.94 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  19.89 
 
 		 538 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  21.99 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  22.57 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  21.99 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  29.95 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  20.95 
 
 		 1033 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  24.45 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  24.45 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  24.23 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  28.31 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  37.5 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  34.12 
 
 		 535 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.62 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3931  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.46 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  39.06 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  21.23 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  29.82 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  22.45 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  39.06 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  43.64 
 
 		 544 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  22.45 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  38.81 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  23.81 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  37.31 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.31 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  31.78 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 493 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 493 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  46.43 
 
 		 503 aa  43.1  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>