33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0329 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  100 
 
 
431 aa  895    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  25.88 
 
 
431 aa  129  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  24.94 
 
 
435 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.86 
 
 
467 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  25.21 
 
 
538 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  22.6 
 
 
454 aa  96.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  26.16 
 
 
449 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.01 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  22.54 
 
 
452 aa  86.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  24.74 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  22.81 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25.96 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  23.18 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  24.68 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  22.45 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  24.55 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  21.16 
 
 
428 aa  64.3  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  24.25 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  22.8 
 
 
1293 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  22.9 
 
 
446 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.02 
 
 
722 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  22.2 
 
 
427 aa  57  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  22.2 
 
 
427 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  23.97 
 
 
520 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  21.36 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  21.11 
 
 
500 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  23.88 
 
 
410 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  28.05 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  21.71 
 
 
549 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  23.5 
 
 
516 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  22.87 
 
 
496 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  22.48 
 
 
507 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>