78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00060 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  100 
 
 
538 aa  1118    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  61.31 
 
 
532 aa  644    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  42.06 
 
 
452 aa  349  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 
460 aa  349  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  40.5 
 
 
454 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  40.16 
 
 
449 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  39.75 
 
 
452 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  28.79 
 
 
1293 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  28.63 
 
 
449 aa  149  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  25.33 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  26.33 
 
 
447 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.16 
 
 
435 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  26.75 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  29.8 
 
 
437 aa  126  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  30.09 
 
 
436 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  26.24 
 
 
500 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  23.9 
 
 
500 aa  124  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  27.62 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  27.88 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  24.95 
 
 
450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  24.14 
 
 
496 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.31 
 
 
480 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.2 
 
 
511 aa  114  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25 
 
 
467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  25.05 
 
 
507 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  23.25 
 
 
472 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  24.27 
 
 
428 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  24.85 
 
 
511 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.21 
 
 
431 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  23.85 
 
 
549 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  27.66 
 
 
516 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  23.52 
 
 
498 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  23.78 
 
 
524 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  23.12 
 
 
494 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  24.21 
 
 
512 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  24.21 
 
 
520 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  23.89 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  24.9 
 
 
465 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  23.89 
 
 
427 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.3 
 
 
1033 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  21.51 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  25.81 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  21.03 
 
 
537 aa  74.7  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  24.12 
 
 
436 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  23.42 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  23.42 
 
 
463 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  23.42 
 
 
463 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  20.89 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  23.27 
 
 
519 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  20.69 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
450 aa  67  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  23.39 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  21.9 
 
 
538 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  19.65 
 
 
722 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  19.52 
 
 
424 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.05 
 
 
491 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  52 
 
 
504 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  36.92 
 
 
535 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  52 
 
 
505 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 
488 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  26.8 
 
 
453 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  27.56 
 
 
453 aa  47.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  38.27 
 
 
493 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  40.35 
 
 
938 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  19.48 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  25.45 
 
 
814 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  35.29 
 
 
492 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  27.5 
 
 
455 aa  44.3  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.3 
 
 
544 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  24.72 
 
 
384 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1290  FAD dependent oxidoreductase  20.48 
 
 
455 aa  44.3  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
520 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  45.1 
 
 
499 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  24.43 
 
 
383 aa  43.9  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  37.7 
 
 
433 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  50.88 
 
 
419 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  40.38 
 
 
571 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  28 
 
 
400 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>