91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1201 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  78.41 
 
 
539 aa  880    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1119    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  48.74 
 
 
538 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  46.79 
 
 
549 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  46.78 
 
 
519 aa  485  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  45.14 
 
 
1033 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  37.97 
 
 
496 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  39.03 
 
 
494 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  39.21 
 
 
498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  40.26 
 
 
520 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  39.96 
 
 
524 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  38.91 
 
 
480 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  38.33 
 
 
516 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  34.77 
 
 
472 aa  329  7e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  36.65 
 
 
500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  38.63 
 
 
512 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  37.5 
 
 
507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  35.69 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  35.91 
 
 
500 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  34.7 
 
 
511 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  35.54 
 
 
500 aa  289  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  30.04 
 
 
465 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  27.86 
 
 
463 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  28.15 
 
 
436 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  27.86 
 
 
463 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  27.49 
 
 
463 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
450 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.59 
 
 
459 aa  146  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.4 
 
 
459 aa  144  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  25.05 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.59 
 
 
722 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  23.27 
 
 
447 aa  98.2  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  23.52 
 
 
436 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  23.57 
 
 
448 aa  90.1  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  24.31 
 
 
435 aa  88.2  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.11 
 
 
449 aa  88.6  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  22.66 
 
 
437 aa  86.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  21.63 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  21.03 
 
 
538 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.58 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  25.63 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  21.05 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 
489 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  20.56 
 
 
532 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  21.99 
 
 
452 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  22.72 
 
 
428 aa  60.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  20.12 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  21.66 
 
 
460 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  22.74 
 
 
419 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  20.8 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.65 
 
 
369 aa  52  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  22.25 
 
 
452 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  23.32 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  22.73 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  26.36 
 
 
460 aa  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  24.68 
 
 
495 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  45.76 
 
 
436 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  25.74 
 
 
383 aa  47.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  47.46 
 
 
557 aa  47.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  39.71 
 
 
436 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  20.15 
 
 
482 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  33.67 
 
 
434 aa  47  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  32.84 
 
 
429 aa  47  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.38 
 
 
441 aa  47  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  43.55 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  43.55 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  42.37 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  43.55 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  41.27 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  44.07 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.47 
 
 
491 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  28.93 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  44.07 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  35.82 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  41.94 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  32.05 
 
 
1293 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  36.07 
 
 
482 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  22.43 
 
 
473 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  36.59 
 
 
949 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  33.33 
 
 
468 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  37.18 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  27.54 
 
 
463 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 
485 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  35.21 
 
 
393 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  33.33 
 
 
468 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  19.92 
 
 
427 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  19.92 
 
 
427 aa  43.9  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  32.91 
 
 
369 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  31.82 
 
 
505 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.62 
 
 
469 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  37.93 
 
 
505 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>