162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2265 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 384 aa  810    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  73.63 
 
 		 383 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  73.89 
 
 		 383 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  73.89 
 
 		 383 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  65.07 
 
 		 381 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  66.05 
 
 		 383 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  66.76 
 
 		 367 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  61.38 
 
 		 381 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  59.84 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  58.78 
 
 		 381 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  58.31 
 
 		 383 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  46.63 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  46.01 
 
 		 395 aa  344  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  46.13 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  45.89 
 
 		 395 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  45.74 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  45.97 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  44.68 
 
 		 395 aa  336  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  45.7 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  44.12 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  45.36 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  43.85 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  44.91 
 
 		 386 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  44.39 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  44.06 
 
 		 413 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  43.92 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  43.8 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  43.8 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  43.8 
 
 		 428 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  44.24 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  44.04 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  42.74 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  41.25 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  42.26 
 
 		 402 aa  308  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 		 395 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  40.94 
 
 		 383 aa  298  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  43.41 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  42.12 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  44.38 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  42.31 
 
 		 372 aa  293  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  42.51 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  42.13 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  42.36 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  42.34 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  43.01 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  40.92 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.13 
 
 		 365 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  39.47 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  40.43 
 
 		 783 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  41.55 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 		 363 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  39.62 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  40.71 
 
 		 383 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  38.65 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 814 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  41.87 
 
 		 783 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  37.97 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 		 376 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  36.78 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  37.29 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  36.46 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  36.22 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  38.01 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  39.13 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  37.02 
 
 		 460 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  31.96 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  35.97 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  34.46 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.13 
 
 		 404 aa  207  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.39 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  27.27 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25.59 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25.59 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  25.57 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.77 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  25.88 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  27.43 
 
 		 511 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  28.48 
 
 		 447 aa  53.1  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  29.05 
 
 		 478 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  32.41 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  32.41 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.29 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  29.63 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  29.63 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  29.63 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  28.57 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  20.75 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  29.63 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  27.27 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  29.63 
 
 		 478 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  26.67 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>