91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1401 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 395 aa  818    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  74.94 
 
 		 415 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  72.49 
 
 		 389 aa  596  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  70.74 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  71.1 
 
 		 395 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  68.45 
 
 		 409 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  68.7 
 
 		 395 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  68.19 
 
 		 395 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  68.62 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  68.01 
 
 		 394 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  68.26 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  69.15 
 
 		 413 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  67.43 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  66.58 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  67.77 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  67.77 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  67.94 
 
 		 402 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  68.3 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  67.35 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  65.79 
 
 		 386 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  62.26 
 
 		 381 aa  491  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  60.72 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  58.29 
 
 		 383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  55.28 
 
 		 413 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  56.7 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  46.95 
 
 		 366 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  46.26 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  45.99 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  45.22 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  43.85 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  43.58 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  42.63 
 
 		 383 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  45.38 
 
 		 367 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  44.03 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 		 381 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 		 384 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  42.3 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  43.25 
 
 		 381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 		 381 aa  302  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 		 391 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  40.52 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  40.78 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.78 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  38.46 
 
 		 379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  39.21 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  43.47 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  40.65 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  43.73 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  39.63 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 814 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.69 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  38.56 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.3 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  40.21 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.61 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  38.59 
 
 		 383 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  41.12 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  37.67 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  39.58 
 
 		 783 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  37.8 
 
 		 783 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  35.64 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  36.83 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  36.57 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.48 
 
 		 391 aa  246  6.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  38.94 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  37.07 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  36.22 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  35.29 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  32.55 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  34.04 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.48 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.82 
 
 		 459 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  23.2 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.82 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.67 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.67 
 
 		 480 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  29.21 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.47 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  26.01 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  27.16 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  31.58 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3838  cyclohexanone monooxygenase  33.78 
 
 		 554 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  36.99 
 
 		 492 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>