86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2575 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  76.08 
 
 		 395 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  83.8 
 
 		 395 aa  705    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 395 aa  819    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  73.67 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  73.28 
 
 		 409 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  72.91 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  72.66 
 
 		 389 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  75.07 
 
 		 386 aa  599  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  71.88 
 
 		 381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  68.56 
 
 		 395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  68.78 
 
 		 394 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  66.84 
 
 		 415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  68.12 
 
 		 413 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  67.43 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  67.61 
 
 		 398 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  66.15 
 
 		 402 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  66.58 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  65.22 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  65.22 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  65.22 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  64.63 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  66.5 
 
 		 399 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  63.02 
 
 		 392 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  62.01 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  60.15 
 
 		 413 aa  494  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  45.6 
 
 		 366 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  46.01 
 
 		 384 aa  345  7e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  45.65 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  44.18 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  45.09 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  44.88 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  45.01 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  43.87 
 
 		 383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  43.92 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  43.43 
 
 		 381 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  43.65 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  42.56 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  42.3 
 
 		 383 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  43.94 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  45.55 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  42.3 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  44.47 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  42.22 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  42.2 
 
 		 381 aa  311  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  42.13 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 365 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  41.6 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  42.29 
 
 		 371 aa  293  5e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  39.31 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  40.96 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  39.42 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  39.2 
 
 		 814 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 		 379 aa  269  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  41.6 
 
 		 376 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  38.11 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  41.33 
 
 		 376 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  37.37 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.57 
 
 		 383 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  38.03 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  37.79 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 		 783 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  35.75 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  40.53 
 
 		 783 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  37.97 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.26 
 
 		 363 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.87 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  37.85 
 
 		 460 aa  246  6e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  39.62 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  34.55 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.52 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  35.9 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  33.77 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.36 
 
 		 375 aa  225  8e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  34.43 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  34.01 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  35.32 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.68 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.56 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.56 
 
 		 459 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  19.89 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  19.59 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  26.32 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.3 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>