90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1179 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  82.11 
 
 		 392 aa  690    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 413 aa  859    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  62.44 
 
 		 386 aa  508  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  59.65 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  59.4 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  59.15 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  59.45 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  60.15 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  55.94 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  57.5 
 
 		 381 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  56.89 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  55.28 
 
 		 395 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  54.95 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  54.57 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  54.7 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  54.19 
 
 		 395 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  54.95 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  53.71 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  53.71 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  54.7 
 
 		 399 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  55.83 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  53.71 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  52.91 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  54.39 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  52.01 
 
 		 383 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  45.04 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  42.56 
 
 		 366 aa  327  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  43.29 
 
 		 372 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  43.22 
 
 		 368 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  41.1 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  41.03 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  41.25 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  43.54 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  41.71 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  41.56 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  41.56 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  41.28 
 
 		 370 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  41.03 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  40.98 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.25 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  37.28 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  39.75 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  40.92 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  39.7 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  40.1 
 
 		 391 aa  283  5.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.29 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  36.55 
 
 		 393 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  36.27 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  35.66 
 
 		 814 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  36.76 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  36.64 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  37.18 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  38.73 
 
 		 363 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  34.94 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  36.13 
 
 		 383 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  35.11 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  36.68 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  35.7 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  36.62 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  35.44 
 
 		 376 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  36.3 
 
 		 460 aa  236  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  35.7 
 
 		 783 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  35.43 
 
 		 370 aa  232  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  35.59 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  34.47 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 783 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  32.75 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  32.51 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  33.85 
 
 		 369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  31.44 
 
 		 375 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  31.77 
 
 		 404 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  29.24 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  30.22 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  31.57 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.65 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.08 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.73 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  29.82 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  22.73 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  35.62 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.51 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.66 
 
 		 1033 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  36.76 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  43.33 
 
 		 433 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>