80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2744 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
373 aa  764    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  70.21 
 
 
375 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  55.94 
 
 
386 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  51.85 
 
 
382 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  52.17 
 
 
369 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  52.43 
 
 
372 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  50.68 
 
 
398 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  51.63 
 
 
814 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  52.32 
 
 
399 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  51.9 
 
 
377 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  49.46 
 
 
383 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  50.81 
 
 
379 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  48.41 
 
 
373 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  47.52 
 
 
391 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  50.54 
 
 
390 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  47.84 
 
 
393 aa  362  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  47.98 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  47.75 
 
 
400 aa  346  3e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  48.79 
 
 
363 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  47.97 
 
 
783 aa  341  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  48.1 
 
 
783 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  47.04 
 
 
404 aa  336  5e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  43.51 
 
 
364 aa  333  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  46.61 
 
 
369 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  42.86 
 
 
376 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  42.06 
 
 
376 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  40.26 
 
 
370 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  39.14 
 
 
415 aa  265  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  37.8 
 
 
395 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  39.29 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  39.04 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  37.8 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  36.1 
 
 
389 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  37 
 
 
380 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  36.83 
 
 
395 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.07 
 
 
396 aa  246  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  35.79 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  37.6 
 
 
367 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  37.29 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  38.65 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  36.91 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  36.91 
 
 
383 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  36.64 
 
 
383 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  35.09 
 
 
395 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  35.45 
 
 
395 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  38.99 
 
 
460 aa  243  6e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  35.81 
 
 
413 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  35.36 
 
 
395 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  37.27 
 
 
391 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  35.56 
 
 
381 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  35.96 
 
 
381 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  38.27 
 
 
370 aa  239  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  34.47 
 
 
395 aa  239  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  37.9 
 
 
372 aa  239  8e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  37 
 
 
367 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  36.15 
 
 
425 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  36.34 
 
 
399 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  36.34 
 
 
399 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  34.92 
 
 
409 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  36.34 
 
 
428 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  35.71 
 
 
398 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  35.62 
 
 
386 aa  233  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  38.32 
 
 
371 aa  233  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  36.91 
 
 
383 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.82 
 
 
391 aa  232  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  33.86 
 
 
395 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  36.99 
 
 
368 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  35.98 
 
 
402 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  35.97 
 
 
391 aa  228  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  37.03 
 
 
370 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  35.39 
 
 
366 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  36.13 
 
 
383 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 
365 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 
392 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  32.75 
 
 
413 aa  222  8e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  33.43 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  35.26 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  35.68 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  24.18 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.67 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>