82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0647 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 400 aa  835    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  52.55 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  49.74 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  45.43 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  47.92 
 
 		 375 aa  355  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  47.75 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  44.62 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  42.15 
 
 		 393 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  41.41 
 
 		 814 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  42.52 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  43.98 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 369 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  40.99 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  42.33 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 		 383 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  40.76 
 
 		 783 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  42.67 
 
 		 783 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  41.1 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  40.31 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.74 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 364 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  41.25 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.82 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  38.22 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  38.48 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  34.53 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  34.53 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  34.53 
 
 		 428 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  35.26 
 
 		 415 aa  215  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  34.44 
 
 		 395 aa  215  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  34.29 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  34.95 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  34.01 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  32.55 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  36.2 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  34.18 
 
 		 402 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  34.18 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  32.92 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  34.46 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  33.51 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  34.45 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  33.51 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  33.59 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  33.76 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  33.59 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  35.09 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  34.48 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  35.14 
 
 		 366 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  33.25 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  32.89 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  32.83 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  33.95 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  32.65 
 
 		 392 aa  199  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  36.79 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  32.22 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  32.56 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  33.51 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 383 aa  196  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  32.21 
 
 		 380 aa  196  9e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  32.82 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  34.55 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  35.68 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  34.46 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  31.46 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  32.99 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 381 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  30.22 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  34.29 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  32.18 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  32.55 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  32.81 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.94 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  20.1 
 
 		 394 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  32.1 
 
 		 492 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  36.36 
 
 		 435 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>