126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3894 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 391 aa  814    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  62.5 
 
 		 381 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  61.38 
 
 		 381 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  59.84 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  57.75 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  57.75 
 
 		 383 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  57.49 
 
 		 383 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  60.16 
 
 		 367 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  57.18 
 
 		 383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  57.37 
 
 		 383 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  54.33 
 
 		 381 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  44.24 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  43.95 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  43.16 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  42.97 
 
 		 389 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  41.69 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  44.35 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  42.04 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  43.39 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  42.67 
 
 		 395 aa  313  4.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  44.15 
 
 		 415 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  43.5 
 
 		 392 aa  311  9e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  41.78 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  43.49 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  43.09 
 
 		 399 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  41.6 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  43.01 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.05 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  41.98 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  41.98 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  41.98 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  41.84 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  41.04 
 
 		 398 aa  295  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  40.98 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  43.56 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  41.8 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  41.07 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  43.58 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  43.96 
 
 		 367 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  42.28 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  41.5 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  42.47 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 380 aa  276  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  42.12 
 
 		 370 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.78 
 
 		 399 aa  269  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  39.61 
 
 		 370 aa  265  8.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  38.64 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  37.47 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  40.6 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  40.05 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  38.2 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  38.44 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  37.99 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  37.01 
 
 		 814 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  37.99 
 
 		 393 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  38.61 
 
 		 369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  38.74 
 
 		 383 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  38.9 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  38.29 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  37.47 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.84 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  39.95 
 
 		 376 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  37.93 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  37.07 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  39.13 
 
 		 376 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  35.73 
 
 		 783 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  37.27 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  36.91 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  37.6 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 		 783 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.62 
 
 		 375 aa  215  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  34.6 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  34.24 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  35.9 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  32.82 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.31 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.6 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  27.34 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  40 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.68 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.14 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  36 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  21.44 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  33.33 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  34.09 
 
 		 483 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  42.37 
 
 		 591 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  27.43 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  34.21 
 
 		 564 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  40.68 
 
 		 511 aa  46.2  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  34.67 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  48.94 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  40 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  41.67 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 		 722 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  26.32 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>