119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2968 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  100 
 
 		 416 aa  828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  73.85 
 
 		 418 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  72.64 
 
 		 418 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  73.06 
 
 		 418 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  70.22 
 
 		 415 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  69.49 
 
 		 417 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  72.64 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  58.19 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  54.59 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  54.61 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  55.24 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  54.29 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  54.29 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  55.79 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  55 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  50.48 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.67 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  50.24 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  45.22 
 
 		 419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  47.56 
 
 		 410 aa  353  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  42.89 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  43.37 
 
 		 417 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.17 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  42.89 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  42.89 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  42.51 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  42.27 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  41.3 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  45.65 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  31.95 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.41 
 
 		 439 aa  126  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.41 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  36.4 
 
 		 562 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  28.63 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.91 
 
 		 444 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.91 
 
 		 481 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  33.81 
 
 		 569 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  27.6 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  27.6 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  27.6 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.87 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  27.29 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  26.56 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.77 
 
 		 477 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  25.6 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.57 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  27.27 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  22.2 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  25.41 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.96 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.13 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.01 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  21.13 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  26.6 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1455  amine oxidase  24.94 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.07 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.02 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  26.42 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.49 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  24.89 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.06 
 
 		 471 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  22.64 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  23.16 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  24.27 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  25.19 
 
 		 624 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  24.27 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  22.38 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  21.48 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  22.11 
 
 		 483 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  28.85 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  29.81 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  21.16 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  21.52 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.27 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  38.67 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  36 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  36.23 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  27.07 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  23.83 
 
 		 429 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  23.6 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  26.67 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  21.22 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.92 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  29.7 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  33.33 
 
 		 599 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.25 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.25 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  21.32 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  27.72 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  35.38 
 
 		 552 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  20.22 
 
 		 500 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  34.38 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  31.4 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.5 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  34.44 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.87 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.98 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  37.1 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>