115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5043 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 381 aa  791    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  72.37 
 
 		 383 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  65.07 
 
 		 384 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  61.7 
 
 		 381 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  59.68 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  59.42 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  59.15 
 
 		 383 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  63.19 
 
 		 367 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  58.16 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  55.82 
 
 		 381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  54.33 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  46.13 
 
 		 381 aa  332  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  47.53 
 
 		 370 aa  330  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  45.01 
 
 		 395 aa  328  8e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  44.26 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  46.24 
 
 		 386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  43.87 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  44.8 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  44.32 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  45.07 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  42.78 
 
 		 409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  43.65 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  45.36 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  44.41 
 
 		 395 aa  312  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  45.7 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  42.32 
 
 		 395 aa  305  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  41.56 
 
 		 413 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  42.74 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  43.63 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  43.67 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  43.67 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 		 365 aa  296  6e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  42.82 
 
 		 399 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  42.82 
 
 		 399 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  42.82 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  42.47 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  42.59 
 
 		 399 aa  292  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  41.34 
 
 		 366 aa  291  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  40.58 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  45.33 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  42.82 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  42.94 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  42.66 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  42.43 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 		 368 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  38.75 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  39.56 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  43.47 
 
 		 369 aa  272  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  39.24 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  41.62 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  40.56 
 
 		 390 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  39.83 
 
 		 399 aa  265  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  41.16 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  41.62 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  37.87 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  40.5 
 
 		 783 aa  259  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.61 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  37.11 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  38.38 
 
 		 373 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  40.77 
 
 		 783 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  39.34 
 
 		 383 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  37.4 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  38.04 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  35.89 
 
 		 814 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  33.07 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  35.68 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  32.91 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  39.23 
 
 		 369 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  34.21 
 
 		 386 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.15 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  36.29 
 
 		 460 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  35.62 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  32.65 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 400 aa  189  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  24.74 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.08 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25.29 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  25.54 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  26.22 
 
 		 500 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  25.22 
 
 		 463 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  30.43 
 
 		 478 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  29.35 
 
 		 482 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25.54 
 
 		 463 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25.54 
 
 		 463 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 487 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  28.57 
 
 		 478 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  26.22 
 
 		 500 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  28.26 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  28.26 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  26.74 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  28.66 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  29.35 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  29.35 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  29.35 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  29.35 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  32.94 
 
 		 487 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>