142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0608 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 381 aa  804    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  60.64 
 
 		 381 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  61.38 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  58.68 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  60 
 
 		 367 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  58.78 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  56.5 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  57.14 
 
 		 383 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  55.97 
 
 		 383 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  56.23 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  55.82 
 
 		 381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  45.11 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  45.9 
 
 		 409 aa  331  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  44.62 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  44.12 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  44.93 
 
 		 415 aa  322  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  43.84 
 
 		 394 aa  318  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  42.9 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  42.47 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  43.32 
 
 		 381 aa  315  7e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  41.94 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  44.35 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  43.84 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  43.25 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  44.72 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  42.28 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  40.26 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  41.21 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  41.03 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  41.58 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  42.01 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  43.26 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  43.45 
 
 		 367 aa  293  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  42.12 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  42.35 
 
 		 413 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  42.54 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  41.26 
 
 		 428 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  41.26 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  41.26 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  41.05 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  42.35 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  40.44 
 
 		 393 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  42.3 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  42.08 
 
 		 399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  41.01 
 
 		 371 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  40.82 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  39.13 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  41.9 
 
 		 370 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  38.93 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  39.66 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  40.21 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  39.18 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  38.03 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  39.17 
 
 		 814 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  38.8 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  38.9 
 
 		 377 aa  266  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 		 783 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  38.95 
 
 		 383 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  38.25 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  39.29 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  39.34 
 
 		 783 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  36.86 
 
 		 370 aa  245  8e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  35.56 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  35.08 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  36.24 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  36.22 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  34.49 
 
 		 382 aa  229  9e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.1 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  36.68 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  35.79 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  32.02 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  32.89 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  31.33 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.61 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  23.25 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  29.34 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  26.95 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  25.31 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  28.24 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  29.24 
 
 		 480 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  35.14 
 
 		 483 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  36 
 
 		 591 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  33.78 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  28.95 
 
 		 484 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  27.72 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  41.82 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.15 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  44.44 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  29.38 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  28.49 
 
 		 511 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  28.95 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  26.54 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  40 
 
 		 478 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>