107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2702 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  88.3 
 
 		 393 aa  727    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 393 aa  814    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  71.96 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  72.3 
 
 		 379 aa  568  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  68.02 
 
 		 783 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  64.82 
 
 		 373 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  67.78 
 
 		 390 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  65.1 
 
 		 814 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  65.28 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  63.43 
 
 		 383 aa  508  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  66.2 
 
 		 783 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  63.71 
 
 		 372 aa  488  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  59.41 
 
 		 377 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  59.12 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  58.5 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  45.38 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  47.84 
 
 		 373 aa  362  9e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  48.39 
 
 		 375 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  47.14 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  45.14 
 
 		 376 aa  338  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  44.32 
 
 		 376 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  44.09 
 
 		 386 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  42.15 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  41.34 
 
 		 391 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  40.11 
 
 		 382 aa  312  7.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  42.52 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  41.22 
 
 		 404 aa  298  8e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  40.59 
 
 		 415 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  41.87 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  40.54 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  40.33 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  39.63 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  42.62 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  39.89 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  42.74 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  38.66 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  40.82 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.67 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  39.19 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  40.21 
 
 		 460 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  38.5 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  38.67 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  38.67 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  40.38 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  38.93 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  40.34 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  39.06 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  40.06 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  38.92 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  40.06 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  38.89 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  36.84 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  41.32 
 
 		 367 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  37.53 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  36.31 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  41.62 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  38.11 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  38.27 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  39.21 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  37.7 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  37.23 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  38.81 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  37.6 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  40.9 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  37.47 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  36.41 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  37.77 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  37.57 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  37.99 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  38.36 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 		 413 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  24.74 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.46 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  29.11 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  22.51 
 
 		 519 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  27.22 
 
 		 500 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  33.03 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  22.17 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.99 
 
 		 511 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  28.45 
 
 		 436 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  23.44 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0229  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.14 
 
 		 580 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.46 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  47.62 
 
 		 551 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3726  choline dehydrogenase  55.88 
 
 		 567 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191041  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  64.52 
 
 		 565 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.29 
 
 		 578 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  24.85 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4211  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.76 
 
 		 559 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.48 
 
 		 556 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.76 
 
 		 532 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>