91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1727 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
404 aa  836    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  52.55 
 
 
400 aa  426  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  49.36 
 
 
386 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  42.71 
 
 
391 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  44.07 
 
 
382 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  47.04 
 
 
373 aa  336  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  46.53 
 
 
375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  44.44 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  42.67 
 
 
814 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  44.16 
 
 
783 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  43.15 
 
 
398 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 
783 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 
372 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  42.86 
 
 
390 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  42.05 
 
 
373 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  41.6 
 
 
383 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  44.07 
 
 
369 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  42.71 
 
 
379 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  41.98 
 
 
393 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  41.22 
 
 
393 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  41.13 
 
 
363 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  41.09 
 
 
377 aa  292  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  39.22 
 
 
364 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  40.86 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  38.23 
 
 
376 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  37.97 
 
 
415 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  38.23 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  36.06 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  35.73 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  37.34 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  34.96 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  35.29 
 
 
395 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  37.47 
 
 
368 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  35.22 
 
 
381 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  36.02 
 
 
394 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  36.13 
 
 
389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  36.12 
 
 
399 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  33.67 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  35.53 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  35.25 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  35.13 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  35.25 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  35.59 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  35.25 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  34.01 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  33.76 
 
 
386 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  34.26 
 
 
392 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  35.16 
 
 
425 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  35.52 
 
 
395 aa  210  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  34.91 
 
 
391 aa  210  4e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  35.35 
 
 
395 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  34.18 
 
 
395 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  34.29 
 
 
367 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  35.46 
 
 
370 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  35.13 
 
 
384 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  35.15 
 
 
398 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  35.17 
 
 
383 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  36.06 
 
 
372 aa  206  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  35.68 
 
 
399 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  35.53 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  33.82 
 
 
391 aa  200  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  33.91 
 
 
402 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  33.08 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  33.58 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  31.33 
 
 
381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  32.91 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  32.82 
 
 
391 aa  196  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  31.77 
 
 
413 aa  195  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  31.3 
 
 
381 aa  193  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  32.47 
 
 
383 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  32.21 
 
 
383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  33.51 
 
 
367 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  31.95 
 
 
383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  32.1 
 
 
383 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  32.65 
 
 
381 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  32.73 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  31.14 
 
 
460 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.43 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  21.66 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  34.88 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
443 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  52.63 
 
 
612 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  39.24 
 
 
544 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  51.22 
 
 
551 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 
511 aa  43.9  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.46 
 
 
555 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.22 
 
 
614 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  46.77 
 
 
442 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0841  oxidoreductase  53.66 
 
 
551 aa  43.1  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.793794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  54.29 
 
 
545 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>