253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4186 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
614 aa  1281    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  65.73 
 
 
607 aa  842    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  51.22 
 
 
623 aa  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  66.06 
 
 
607 aa  847    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2098  putative dehydrogenase large subunit protein  41.91 
 
 
612 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.71 
 
 
752 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  37.25 
 
 
752 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.4 
 
 
752 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
662 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.67 
 
 
662 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.67 
 
 
662 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.38 
 
 
662 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.21 
 
 
538 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  35.34 
 
 
539 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.67 
 
 
545 aa  287  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.17 
 
 
536 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.89 
 
 
540 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.05 
 
 
539 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.05 
 
 
539 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.05 
 
 
539 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.21 
 
 
539 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.45 
 
 
533 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  32.99 
 
 
537 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.35 
 
 
533 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.35 
 
 
533 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.35 
 
 
533 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.79 
 
 
539 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  32.94 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  32.94 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  32.94 
 
 
537 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  32.94 
 
 
537 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  32.94 
 
 
537 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  32.94 
 
 
537 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  32.94 
 
 
537 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.45 
 
 
539 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.94 
 
 
539 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.76 
 
 
539 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  31.76 
 
 
551 aa  255  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.29 
 
 
544 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.4 
 
 
552 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.81 
 
 
534 aa  247  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.2 
 
 
550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.27 
 
 
531 aa  201  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.41 
 
 
545 aa  193  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.2 
 
 
533 aa  180  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.2 
 
 
527 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 
518 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  24.83 
 
 
539 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  27.01 
 
 
528 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4670  choline dehydrogenase-like flavoprotein  27.27 
 
 
478 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0703924  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.97 
 
 
566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  26.35 
 
 
480 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.93 
 
 
578 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 
579 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  26.01 
 
 
483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.79 
 
 
522 aa  137  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.52 
 
 
561 aa  137  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.62 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.78 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.04 
 
 
522 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 
565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26 
 
 
522 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 
559 aa  134  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26 
 
 
522 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.32 
 
 
565 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 
569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.39 
 
 
526 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.64 
 
 
567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.56 
 
 
581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 
560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.91 
 
 
556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.12 
 
 
578 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  25.49 
 
 
549 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.06 
 
 
553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.65 
 
 
570 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.95 
 
 
561 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  24.72 
 
 
573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.3 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.63 
 
 
522 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.12 
 
 
563 aa  126  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  25.68 
 
 
480 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.1 
 
 
525 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.85 
 
 
573 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.56 
 
 
566 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0154  2-keto-gluconate dehydrogenase subunit-like  25.3 
 
 
475 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.01 
 
 
582 aa  124  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.71 
 
 
570 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.71 
 
 
522 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.13 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.63 
 
 
572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.38 
 
 
526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 
572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.08 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.61 
 
 
553 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.5 
 
 
523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.03 
 
 
573 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.58 
 
 
563 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  25.93 
 
 
522 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  22.1 
 
 
561 aa  120  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>