More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5469 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 526 aa  1092    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.04 
 
 		 515 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.08 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.54 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.78 
 
 		 573 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.3 
 
 		 556 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.53 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.72 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  41.83 
 
 		 547 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  43.7 
 
 		 563 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.1 
 
 		 526 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.4 
 
 		 547 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  43.7 
 
 		 563 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  43.7 
 
 		 563 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.44 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.56 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.26 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.48 
 
 		 518 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.36 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.82 
 
 		 527 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  35.43 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.79 
 
 		 527 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  34.33 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.48 
 
 		 528 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.79 
 
 		 553 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.63 
 
 		 522 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.63 
 
 		 522 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  33.64 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.5 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.16 
 
 		 523 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.97 
 
 		 522 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.77 
 
 		 525 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  33.45 
 
 		 549 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.71 
 
 		 534 aa  226  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.14 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.21 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  31.84 
 
 		 523 aa  219  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  32.96 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.52 
 
 		 533 aa  212  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.76 
 
 		 550 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.32 
 
 		 545 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.33 
 
 		 545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.74 
 
 		 531 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.63 
 
 		 533 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.88 
 
 		 563 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.9 
 
 		 594 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.29 
 
 		 533 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.29 
 
 		 533 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.63 
 
 		 533 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  29.38 
 
 		 594 aa  186  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.92 
 
 		 534 aa  183  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.43 
 
 		 538 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.36 
 
 		 561 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  27.44 
 
 		 573 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.06 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.5 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.06 
 
 		 572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.26 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.26 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.26 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.7 
 
 		 544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.09 
 
 		 539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.44 
 
 		 540 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.47 
 
 		 591 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  29.01 
 
 		 539 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.18 
 
 		 545 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  29.64 
 
 		 591 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  29.64 
 
 		 591 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  30.25 
 
 		 551 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.58 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.22 
 
 		 591 aa  163  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  29.78 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.04 
 
 		 592 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.54 
 
 		 539 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.07 
 
 		 578 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.88 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.88 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.06 
 
 		 566 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.48 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  28.1 
 
 		 549 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  28.87 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  28.87 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  28.87 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  28.87 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  28.87 
 
 		 537 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  28.87 
 
 		 537 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  28.87 
 
 		 537 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 		 572 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.37 
 
 		 582 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.72 
 
 		 570 aa  156  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  29.93 
 
 		 591 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.98 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.96 
 
 		 565 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  27.78 
 
 		 565 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.56 
 
 		 549 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.26 
 
 		 594 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  27.68 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.4 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.69 
 
 		 755 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>